Os trabalhos realizados visam aumentar o conhecimento sobre os mecanismos chave da imunidade/resistência do cafeeiro e da patogenicidade dos fungos Hemileia vastatrix e Colletotrichum kahawae combinando as áreas da biologia celular, metabolómica, proteómica transcritómica e genómica funcional. 

Estes estudos têm por principal objectivo a identificação de biomarcadores potencialmente associados à resistência duradoura do cafeeiro aos referidos fungos patogénicos, para serem usados nos programas de melhoramento genético.

• Interacção Cafeeiro - H. vastatrix 
• Interacção Cafeeiro - C. kahawae 
• Efectores dos Patógenos