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Diversidade genética e evolução dos patógenos
No âmbito da linha de investigação dedicada ao estudo da genética populacional e evolutiva dos fungos patogénicos do cafeeiro (H. vastatrix e C. kahawae), temos estado focados na aplicação de marcadores genéticos e abordagens genómicas para: i) investigar padrões de diversidade e diferenciação genética dos patógenos, bem como da distribuição espacial da variação genética, visando compreender a dinâmica epidemiológica e a sua história evolutiva; ii) identificar genes candidatos e mecanismos genómicos envolvidos na adaptação ao hospedeiro e na evolução da virulência; iii) identificar marcadores moleculares associados a patótipos específicos.
O nosso trabalho de investigação permitiu já o desenvolvimento de novos marcadores de DNA para o complexo de espécies de Colletotrichum gloesporioides, que se revelaram fundamentais para a distinção de espécies de Colletotrichum filogeneticamente muito próximas e para a identificação inequívoca de C. kahawae. O subsequente estudo populacional de C. kahawae revelou a existência de uma estruturação genética geograficamente associada e a provável origem geográfica da espécie. Os resultados obtidos neste estudo levaram ainda à proposta de uma nova hipótese de especiação de C. kahawae através de um processo de especiação ecológica por salto-de-hospedeiro, contrariando as hipóteses anteriores há muito estabelecidas.
