Estrutura
- Conselho de Gestão da Qualidade do ISA
- Comissão para a Igualdade e Inclusão e Não Discriminação do ISA
- Comissão da Pós-Graduação
- Órgão Responsável pelo Bem-Estar Animal
- Departamento de Ciências e Engenharia de Biossistemas (DCEB)
- Departamento dos Recursos Naturais, Ambiente e Território (DRAT)
- Antigos Departamentos
- Centro de Ecologia Aplicada "Professor Baeta Neves" (CEABN)
- Centro de Estudos Florestais (CEF)
- Centro de Investigação LEAF (Linking Landscape, Environment, Agriculture and Food)
- Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos (CIBIO)
- Direcção Administrativa e Financeira (DAF)
- Núcleo de Orçamento, Contabilidade e Faturação (NOCF)
- Núcleo de Compras, Aprovisionamento e Expediente (NCAE)
- Núcleo de Recursos Humanos (NRH)
- Divisão Académica (DA)
- Biblioteca do ISA (BISA)
- Divisão de Infraestruturas, Segurança e Ambiente (DISA)
- Núcleo dos Espaços Verdes (NEV)
- Divisão de Informática (DI)
- Jardim Botânico da Ajuda (JBA)
- Laboratório de Estudos Técnicos (LET)
- Laboratório de Patologia Vegetal "Veríssimo de Almeida" (LPVVA)
- Centro de Investigação das Ferrugens do Cafeeiro
- Grupo de Interações Planta Ambiente & Biodiversidade
- Espaços da Tapada
- Herbário "João de Carvalho e Vasconcelos"
- Parque Botânico da Tapada da Ajuda
- Viveiro Florestal do ISA
- Editora ISAPress
- Associação dos Estudantes do ISA (AEISA)
- Associação dos Antigos Alunos do ISA (AISA)
- Associação Portuguesa de Enologia (APE)
- Associação Portuguesa de Estudantes Florestais (APEF)
- Associação Portuguesa de Ecologia da Paisagem (APEP)
- Associação Portuguesa de Horticultura (APH)
- Associação Portuguesa de Jovens Enófilos (APJE)
- Associação Portuguesa para a Diversidade da Videira (PORVID)
- International Association of Agricultural Students (IAAS)
- Núcleo de Estudantes Africanos do ISA (NEAISA)
- Sociedade Portuguesa de Ciências Florestais (SPCF)
- Sociedade Portuguesa da Ciência do Solo (SPCS)